Scopul Secției achiziții medicamente constă în planificarea și desfășurarea procedurilor de achiziții publice conform necesarelor de medicamente prezentate de către Ministerul Sănătății (în contextul Programelor Naționale și Speciale) și de către instituțiile medico-sanitare publice și autoritățile/instituțiile care prestează servicii medicale și sociale cu care Centrul pentru Achiziții Publice Centralizate în Sănătate a încheiat contracte de prestări servicii (în contextul procedurilor centralizate de achiziții publice).